Setiap motif batik warna alam dari batikpohon dibuat melalui proses yang diawali dengan pembuatan pola yang biasanya disebut dengan sungging. Batikpohon berupaya agar setiap lembar batik bisa menjadi master piece. Bukan satu master untuk dibuat beberapa pis (pis adalah penyebutan satu gulung bahan polos kain batik yang isinya sekitar 40 meteran atau lebih), seperti halnya batik massal. Di workshop batikpohon proses sungging ini dimulai hingga menjadi kain batik jadi dengan jumlah 1 hingga 4 lembar untuk setiap motif dengan warna yang berbeda.